但有两点，是国子监的儒学教授们，无论如何也接受不了的，其一是他在讲课时蔑视权威，认为绝大多数历史著作，都是‘是非尽合于圣人’，以儒家‘道德至上’的标准，来评价历史事件和历史人物，这种方法十分的不客观，使很多古人蒙冤难雪，也使后代的读书人人云亦云，是非不分。
所以他在给学生讲课的过程中，十分爱干的一件事，便是为古人翻案，他认为应当以人物对历史的贡献来衡量其地位，而不是从道德出发。
在重回国子监的半年里，他为很多已被盖棺定论的古人翻了案，其中最有震撼效果的有三位——其一，是秦始皇。因为秦始皇‘焚书坑儒’，所以两千年来，他一直遭儒生唾骂，鲜有对其功过是非做出客观评价的。而李贽则公然称秦始皇为‘千古一帝’，认为他统一诸侯，废封建、立郡县，结束了春秋战国以来长期的混战局面，实现了国家统一，其贡献要远远超过所犯的错误，其雄材大略与千秋之功，是后世皇帝无法比拟的。
还有武则天，按照传统观念，都认为她是‘篡政’，有悖封建的伦理纲常，所以历代史学家，对武则天的评价都是否定的，甚至那些卫道士，更是骂武则天是‘牝鸡司晨’。在几乎众口一词挞伐声中，李贽却高呼武则天‘胜高宗十倍、中宗万倍’。他认为武皇帝‘专以爱养人才为心，安民为念’，仅此一点，就可以是绝大多数帝王比不上的。
第三个不是皇帝，但李贽为她翻案，所引起的震动效果，却比前两者加起来都大，她就是卓文君。卓文君与司马相如私奔的爱情故事，历朝历代都被定性为‘卓文君失身于司马相如’的，那绝不是歌颂对象，而是伤风败俗，即使女子也以她为耻的。
对此，李贽大声驳斥道：‘文君正获身，非失身！’他的意思是，卓文君随司马相如私奔是‘善择佳偶’，是对爱情、对幸福的勇敢追求！
这还得了？在这个三纲五常的年代，女子向来都是男人的附属品，幸福也好、痛苦也罢，所有的一切，都应该是男人赐予的，李贽却在这儿鼓励女子主动追求属于自己的幸福？如此嚣张，纲常何在？天理何在？
所以卫道士们对他愤怒，也就可想而知了。但让他们更害怕的，是李贽所主张的——童心说！
李贽是泰州学派的重要弟子，虔诚信奉心学，并在王阳明‘良知之学’的基础上，发展出了他自己的学说——童心说，其核心是‘童心即真心’、‘夫童心者，绝假纯真，最初一念之本心也。若失却童心，便失却真心；失却真心，便失却真人。’李贽认为，人最宝贵的财富，就是自我；要想保住自我，必须保持本心，而社会的伦理教化、风气纲常，会使童心被遮蔽，所谓‘童心既障，于是发而为言语，则言语不由衷；见而为政事，则政事无根柢；著而为文辞，则文辞不能达……’
他尖锐的反对人云亦云，批判迷信权威，也就是‘不以孔子是非为是非’，要尊重自我本性！
这个就太狠了！要知道从西汉‘罢黜百家，独尊儒术’以后，儒学就成为占统治地位的意识形态，孔子的思想行为，便成为人们的行为准则，孔子的好恶取舍，也成为人们判断是非的标准。到了宋朝朱熹，又提出了‘存天理，灭人欲’的伦理主张，要求所有人都遵守儒家的纲常道德，要消灭个人的欲望，而作为‘欲望’的主体，本我真心也必须被扼杀！
所以李贽的思想，与传统的程朱理学针尖麦芒、水火不容，令那些卫道士感到如芒在背，当然要除之而后快了。
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了解了李贽现在的处境，沈默对他的不满也烟消云散了，给他斟一杯茶道：“宏甫兄，对将来有什么打算？”
李贽抬起头来，道：“我对这句话的理解是——李贽，你可以卷铺盖走人了。”
沈默不禁哑然失笑道：“想到哪里去了？像你这样宝贵的财富，我唯恐留之不及，又怎会往外推呢？”
李贽不信道：“像我这样的麻烦，哪个上司不是拼命往外推，你怎么会例外呢？”
沈默微微一笑，盯着他的眼睛道：“那我问你，你的学说是对还是错？”
“当然是正确的了！”李贽提高声调道，他愿意用生命捍卫自己的学术，被沈默一问，便如斗鸡一般，竖起了浑身的羽毛，仿佛要随时开战一般。
“别激动，别激动，我可不愿跟你辩论，”沈默赶紧摆摆手道：“我只是想问问你，如果你的学术推广开来，对这个国家有好处？还是坏处？”
李贽顿了顿，没有正面回答，而是缓缓道：“歪理和谬论也许会带来一时的好处，但时间一长，其害必现！”说着直视沈默道：“而正理和真相，也许会带来阵痛，但阵痛过后，却可以纠正错误，让事情的发展回到正确的道路上。”
“那你是歪理还是正理呢？”沈默微微笑道。
“我坚信，正理站在我这一边！”李贽坚定道。
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